The end is Nigh é baseado no filme lançamento Watchmen, dirigido por Zack Snyder, baseado em um dos mais aclamados e Best-selling de DC Comics. O game se inicia 10 anos antes da história principal do filme, com o héroi Keene Act Still ha alguns anos longe, enquanto o crime e o terror tomavam as ruas. Se prepare para um hardcore, para vivenciar as experiências das lutas nas ruas como Nite Owl e Rorschach, buscando acabar com os criminosos e revelar as perigosas conspirações. Watchmen se encontra entre a subversão, imoralidade e corrupção dos níveis mais altos de poder e suas ramificações chegando até os lugares mais obcuros das ruas de NYC.

Watchmen: The End Is Nigh Parte 1 acompanha a busca de Rorschach e Nite Owl pelo cruel Underboss, que acabou de fugir da prisão e mandou seus capangas aterrorizar New York. A cidade precisa de heróis e apenas os vigilantes mascarados podem atender ao chamado.

Watchmen: The End Is Nigh Parte 2 aprofunda a parceria entre Rorschach e Nite Owl antes da Lei Keene banir os heróis. Na Parte 2, o Rorschach pede a ajuda de Nite Owl para solucionar o caso de Violet Greene, uma menina desaparecida. Durante a investigação, Rorschach descobre que uma mulher do seu passado está envolvida com o desaparecimento, causando um conflito de interesses entre os parceiros.