Em Size Matters, o jogador se vê na missão de salvar Luna, uma menina que foi raptada por robôs misteriosos. Com as diversas reviravoltas dessa história, em pouco tempo, a dupla intergaláctica Ratchet e Clank precisa cumprir outros objetivos, descobrindo que há muito mais a ser revelado do que se pode imaginar à primeira vista.
Ratchet, o personagem que é controlado na maior parte do tempo, aparece com todo o seu arsenal dos títulos anteriores, incluindo a enorme chave inglesa, pistolas a laser, lança-foguetes, rifles de alta precisão, bombas de ácido, robôs de miniatura que atacam os inimigos mais próximos, entre outros. À medida que eliminam os inimigos, as armas ganham pontos de experiência, ficando cada vez mais poderosas.
O jogo mantém a qualidade gráfica já conhecida no PS2, oferecendo um grande detalhamento do cenário.