Com algumas novidades e características, juntamente com multiplayer on-line, o jogo demonstra que sofreu um real upgrade, sem perder suas tão famosas e carismáticas características clássicas. Para jogar basta você apertar um dos quatro botões frontais do PSP no momento certo, acompanhando as músicas. Fazendo isso corretamente você permitirá que seu pequeno exército de Patapons marche, pule, ataque e até traga reforços.

A história é uma seqüência direta de Patapon 2. No final da última aventura, os incansáveis Patapons conseguiram construir uma ponte, que os levou a uma arca. Porém, ao abri-la eles acabaram por libertar sete espíritos maléficos que transformaram todos os Patapons desse evento em pedra! Assim, cabe a você e seu novo exército a missão de salvar seus amigos, trazendo-os de volta a sua forma normal, prendendo novamente os espíritos. Então chega de chegar nos confins da Terra, o negócio agora é um novo, perigoso e aventureiro objetivo! E se você está achando que será algo rápido e fácil, deixe-me adiantar que o jogo conta com mais de 80 missões entre partidas single-player! Sem falar das missões multiplayer!

Você conta com as mais diversas classes, como arqueiros ou atiradores de lanças e você terá que lidar com as mais estranhas criaturas e ameaças que surgirão no desenrolar da aventura. O jogo funciona de uma forma tão harmoniosa que você gastará horas jogando sem perceber (assim como acontecia nos demais jogos da série)! A grande diferença entre Patapon 3 e seus demais games é a chance de escolher seu próprio herói ao iniciar o jogo! Nos dois primeiros games Patapon o jogador simplesmente era um Deus, mas dessa vez você irá escolher uma criatura viva! Mesmo no corpo de um Patapon, você controlará todo o exército, como sempre.